5 References
[1] J. Walther, R. Godawat, C. Hwang, Y. Abe, A. Sinclair, K. Konstantinov, J. Biotechnol. 2015 , 213 , 3-12.
[2] N. Ziv, N. J. Brandt, D. Gresham, JoVE 2013 , e50168.
[3] K. Peebo, P. Neubauer, Microorganisms 2018 ,6 .
[4] S. J. Yeom, D. H. Lee, Y. J. Kim, J. Lee, K. K. Kwon, G. H. Han, H. Kim, H. S. Kim, S. G. Lee, PLoS One 2016 , 11 , e0166890.
[5] J. Kopp, A.-M. Kolkmann, P. G. Veleenturf, O. Spadiut, C. Herwig, C. Slouka, Front. Bioeng. Biotech. 2019 ,7 .
[6] A. Schmideder, D. Weuster-Botz, J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2017 , 44 , 1021-1029.
[7] F. W. Studier, B. A. Moffatt, J. Mol. Biol.1986 , 189 , 113-130.
[8] S. B. Noronha, H. J. C. Yeh, T. F. Spande, J. Shiloach,Biotechnol. Bioeng. 2000 , 68 , 316-327.
[9] G. L. Rosano, E. A. Ceccarelli, Front. Microbiol.2014 , 5 , 172.
[10] O. Zelder, B. Hauer, Curr. Opin. Microbiol.2000 , 3 , 248-251.
[11] P. Rugbjerg, N. Myling-Petersen, A. Porse, K. Sarup-Lytzen, M. O. A. Sommer, Nat. Commun. 2018 , 9 , 787.
[12] P. Rugbjerg, M. O. A. Sommer, Nat. Biotechnol.2019 , 37 , 869-876.
[13] B. R. Glick, Biotechnol. Adv. 1995 , 13 , 247-261.
[14] L. De Gelder, J. M. Ponciano, P. Joyce, E. M. Top,Microbiology 2007 , 153 , 452-463.
[15] G. Striedner, I. Pfaffenzeller, L. Markus, S. Nemecek, R. Grabherr, K. Bayer, Biotechnol. Bioeng. 2010 ,105 , 786-794.
[16] B. Csorgo, T. Feher, E. Timar, F. R. Blattner, G. Posfai,Microb. Cell. Fact. 2012 , 11 , 11.
[17] D. E. Deatherage, D. Leon, A. E. Rodriguez, S. K. Omar, J. E. Barrick, Nucleic. Acids. Res. 2018 , 46 , 9236-9250.
[18] A. Schuller, M. Cserjan-Puschmann, C. Tauer, J. Jarmer, M. Wagenknecht, D. Reinisch, R. Grabherr, G. Striedner, Microb. Cell. Fact. 2020 , 19 , 58.
[19] B. Miroux, J. E. Walker, J. Mol. Biol. 1996 ,260 , 289-298.
[20] J. E. Barrick, D. S. Yu, S. H. Yoon, H. Jeong, T. K. Oh, D. Schneider, R. E. Lenski, J. F. Kim, Nature 2009 ,461 , 1243-1247.
[21] S. K. Kwon, S. K. Kim, D. H. Lee, J. F. Kim, Sci. Rep.2015 , 5 , 16076.
[22] L. Dumon-Seignovert, G. Cariot, L. Vuillard, Protein Expr. Purif. 2004 , 37 , 203-206.
[23] R. P. Maharjan, T. Ferenci, PLoS Biol. 2017 ,15 , e2001477.
[24] R. P. Maharjan, T. Ferenci, Environ. Microbiol. Rep.2018 , 10 , 626-633.
[25] C. B. Glascock, M. J. Weickert, Gene 1998 ,223 , 221-231.
[26] S. K. Sharan, L. C. Thomason, S. G. Kuznetsov, D. L. Court,Nat. Protoc. 2009 , 4 , 206-223.
[27] B. P. Cormack, R. H. Valdivia, S. Falkow, Gene1996 , 173 , 33-38.
[28] M. Fink, S. Vazulka, E. Egger, J. Jarmer, R. Grabherr, M. Cserjan-Puschmann, G. Striedner, Biotechnol. J. 2019 ,14 , e1800637.
[29] C. Toeroek, M. Cserjan-Puschmann, K. Bayer, G. Striedner,SpringerPlus 2015 , 4 .
[30] F. W. Studier, Protein Expr. Purif. 2005 ,41 , 207-234.
[31] H. Reischer, I. Schotola, G. Striedner, F. Potschacher, K. Bayer, J. Biotechnol. 2004 , 108 , 115-125.
[32] F. He, Bio-protocol 2011 , 1 , e97.
[33] A. M. Bolger, M. Lohse, B. Usadel, Bioinformatics2014 , 30 , 2114-2120.
[34] H. Jeong, H. J. Kim, S. J. Lee, Genome Announc.2015 , 3 , e00134-00115.
[35] D. E. Deatherage, J. E. Barrick, Methods Mol. Biol.2014 , 1151 , 165-188.
[36] D. Kim, B. Langmead, S. L. Salzberg, Nat. Methods2015 , 12 , 357-360.
[37] R. Luo, B. Liu, Y. Xie, Z. Li, W. Huang, J. Yuan, G. He, Y. Chen, Q. Pan, Y. Liu, J. Tang, G. Wu, H. Zhang, Y. Shi, Y. Liu, C. Yu, B. Wang, Y. Lu, C. Han, D. W. Cheung, S. M. Yiu, S. Peng, Z. Xiaoqian, G. Liu, X. Liao, Y. Li, H. Yang, J. Wang, T. W. Lam, J. Wang,Gigascience 2012 , 1 , 18.
[38] P. J. Cock, T. Antao, J. T. Chang, B. A. Chapman, C. J. Cox, A. Dalke, I. Friedberg, T. Hamelryck, F. Kauff, B. Wilczynski, M. J. de Hoon, Bioinformatics 2009 , 25 , 1422-1423.
[39] S. Kurtz, A. Phillippy, A. L. Delcher, M. Smoot, M. Shumway, C. Antonescu, S. L. Salzberg, Genome Biol. 2004 , 5 , R12.
[40] H. Lee, E. Popodi, H. Tang, P. L. Foster, Proc. Natl. Acad. Sci. U S A 2012 , 109 , E2774-2783.
[41] R. Maharjan, T. Ferenci, Mol. Biol. Evol. 2015 ,32 , 380-391.
[42] A. Porco, N. Peekhaus, C. Bausch, S. Tong, T. Isturiz, T. Conway, J. Bacteriol. 1997 , 179 , 1584-1590.
[43] N. Peekhaus, T. Conway, J. Bacteriol. 1998 ,180 , 1777-1785.
[44] J. Y. Liu, P. F. Miller, M. Gosink, E. R. Olson, Mol. Microbiol. 1999 , 31 , 1845-1851.
[45] R. D. Simoni, S. Roseman, M. H. Saier, Jr., J. Biol. Chem. 1976 , 251 , 6584-6597.
[46] R. Schinzel, B. Nidetzky, FEMS Microbiol Lett1999 , 171 , 73-79.
[47] M. Yamada, M. H. Saier, J. Mol. Biol. 1988 ,203 , 569-583.
[48] T. Elssner, C. Engemann, K. Baumgart, H. P. Kleber,Biochemistry 2001 , 40 , 11140-11148.
[49] A. Fernandez-Castane, C. E. Vine, G. Caminal, J. Lopez-Santin,J. Biotechnol. 2012 , 157 , 391-398.
[50] D. A. Siegele, J. C. Hu, W. A. Walter, C. A. Gross, J. Mol. Biol. 1989 , 206 , 591-603.
[51] T. Gardella, H. Moyle, M. M. Susskind, J. Mol. Biol.1989 , 206 , 579-590.
[52] J. M. Couto, A. McGarrity, J. Russell, W. T. Sloan,Microb. Cell Fact. 2018 , 17 , 8.
[53] N. Rai, L. Huynh, M. Kim, I. Tagkopoulos, Biotechnol. Bioeng. 2019 , 116 , 693-703.