Target gene
Primer name
(5’-3’)
Product size (bp)
Archaeal amoA Arch-amoAF STAATGGTCTGGCTTAGACG 635
Arch-amoAR GCGGCCATCCATCTGTATGT
Bacterial amoA bamoA1F GGGGTTTCTACTGGTGGT 491
bamoA2R CCCCTCKGSAAAGCCTTCTTC
nirS cd3aF GTSAACGTSAAGGARACSGG 425
R3cdR GASTTCGGRTGSGTCTTGA
nirK FlaCuF ATCATGGTSCTGCCGCG 471
R3CuR GCCTCGATCAGRTTGTGGTT
nosZ CHEND-nosZ-1126F GGGCTBGGGCCRTTGCA 255
CHEND-nosZ-1381R GAAGCGRTCCTTSGARAACTTG